孙中山纪念馆位于中山陵园藏经楼，藏经楼建于1935年，包括主楼、僧房和碑廊三部分。抗日战争时期，藏经楼遭到侵华日军的严重破坏，1982年，国家拨款重修藏经楼，改为孙中山纪念馆。

主楼是一座重檐歇山式宫殿建筑，外观为三层，实际中间还有一层夹层。底层为大厅，轩敞明亮，大厅顶部饰有镏金的莲花形藻井，流光溢彩，富丽堂皇。藻井正中高悬火炬形大吊灯，大厅中央矗立一座孙中山先生半身铜像，正面壁上是阴刻的胡汉民手书《总理遗嘱》，两侧是孙中山手书的“人类进化”、“世界大同”楹联，蓝底金字，隶书阴刻。大厅四壁嵌有四幅反映孙中山从事革命活动的大型木刻浮雕：“出国宣传”、“商讨革命”、“振聋发聩”和“讨袁护国”。厅内还设有大屏幕投影电视，连续播映纪录孙中山安葬中山陵实况的历史纪实片《奉安大典》。

二楼是一座走马楼，四周有回廊，可凭栏俯视底层大厅。回廊北壁为长12米、高1.8米的大型木雕，镌刻孙中山先生手书的《建国大纲》全文。木匾底色为宝蓝色，金字阴刻。另三面壁上悬 挂反映孙中山革命生涯的11幅油画，这些油画，以孙中山领导和发动的民和革命为主线，选择重大的历史事件。

三楼和四楼是孙中山纪念馆的主体陈列《孙中山先生生平事迹展》共有五个展厅，分为七个部分。展线长180米，展出历史图片共315幅，还有各种文物、模型近百件，展示了孙中山先生伟大而光辉的一生。

主楼后有一座长达125米的大型碑廊。碑廊左右对称，中轴线上筑有僧房五间，两翼有回廊及碑亭二座相连，廊壁嵌有冯玉祥将军赠送的河南嵩山青石碑138块。碑廊镌刻孙中山所著的《三民主义》全文，共十六讲，十五万五千余字，由民国时期的十四位书法家书写，全部是楷书阴刻，风格各异，造诣精湛，堪称当代书法艺术中的精品，具有很高的欣赏价值。